重粒子线治疗是获得厚生劳动大臣批准的先进医疗之一。接受先进医疗治疗之部分其所需的费用由患者自己全额负担。不过与常规治疗相同的部分(诊断、检查和投药等)的费用可使用公共医疗保险。

此外，现在民间保险公司有许多保障先进医疗费用的保险商品(“癌保险”或“医疗保险”等)出售。详情请询问各保险公司。